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苹果手机购买软件所扣除的费用是从您的Apple ID余额或绑定的银行卡中扣除的。具体来说，当您在App Store购买软件或进行其他消费时，系统会根据您的支付设置自动选择支付方式。如果Apple ID余额充足，系统就会从余额中扣款；如果没有足够的余额，系统会根据您的支付设置选择其他支付方式，如绑定的银行卡等。
1、打开iPhone的“设置”应用。
2、点击顶部的Apple ID，通常显示用户的名字和头像。
3、点击“iTunes Store与App Store”。
4、在顶部，点击您的Apple ID，然后点击“查看Apple ID”，可能需要输入Apple ID的密码或使用Face ID或Touch ID进行验证。
5、在“账户设置”页面，点击“付款与配送”，在这里可以看到当前的支付方式和默认支付方式。
如果您对购买软件的扣费情况有任何疑问，可以登录您的Apple账户查看交易记录，或者联系苹果客服进行咨询，确保您的支付方式安全，并定期检查您的账户以监控任何未经授权的购买。